Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MsmbO08540 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
MsmbO08540 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MsmbO08540 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms