Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8050L7N2E3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8050L7N2E3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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