Protein–RNA interactions for Protein: L7N291

Gm8857, Predicted gene 8857 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8857L7N291 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm8857L7N291 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm8857L7N291 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm8857L7N291 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm8857L7N291 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm8857L7N291 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm8857L7N291 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm8857L7N291 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm8857L7N291 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8857L7N291 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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