Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms