Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms