Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm21976J3QNN2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm21976J3QNN2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm21976J3QNN2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gm21976J3QNN2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21976J3QNN2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gm21976J3QNN2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21976J3QNN2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21976J3QNN2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21976J3QNN2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21976J3QNN2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21976J3QNN2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21976J3QNN2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21976J3QNN2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21976J3QNN2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21976J3QNN2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21976J3QNN2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21976J3QNN2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21976J3QNN2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21976J3QNN2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21976J3QNN2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21976J3QNN2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21976J3QNN2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21976J3QNN2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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