Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21897J3KMP5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21897J3KMP5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms