Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r34G3XA52 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r34G3XA52 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms