Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms