Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5218F6YH22 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms