Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U0

Kcnmb3, Potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb3E9Q7U0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms