Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Usp31E9Q6Y8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Usp31E9Q6Y8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Usp31E9Q6Y8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Usp31E9Q6Y8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Usp31E9Q6Y8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Usp31E9Q6Y8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp31E9Q6Y8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp31E9Q6Y8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp31E9Q6Y8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms