Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FancfE9Q5Z5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FancfE9Q5Z5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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