Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms