Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1B3

Gm7275, Predicted gene 7275, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7275E9Q1B3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm7275E9Q1B3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm7275E9Q1B3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms