Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms