Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms