Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms