Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cngb1E1AZ71 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms