Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl3E0CZ16 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms