Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SafbD3YXK2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SafbD3YXK2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms