Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apol6B7ZC55 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apol6B7ZC55 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms