Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms