Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apol7aB2RT54 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms