Protein–RNA interactions for Protein: A2AQH1

Cerkl, Ceramide kinase-like, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CerklA2AQH1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CerklA2AQH1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CerklA2AQH1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms