Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Rtf1A2AQ19 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtf1A2AQ19 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms