Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll9A2APC3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms