Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3fA2ANE1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms