Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fam43bA2AM80 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam43bA2AM80 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam43bA2AM80 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms