Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Pramef6A2A8M8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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