Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P4

Ighv5-16, Immunoglobulin heavy variable 5-16 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms