Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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