Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G9

Trbv5, T cell receptor beta, variable 5 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv5A0A0B4J1G9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Trbv5A0A0B4J1G9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Trbv5A0A0B4J1G9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Trbv5A0A0B4J1G9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Trbv5A0A0B4J1G9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Trbv5A0A0B4J1G9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trbv5A0A0B4J1G9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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