Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC093627.3-201ENST00000467050 574 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP22-201ENST00000491037 413 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC097460.2-201ENST00000511857 741 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 PROSER3-207ENST00000537459 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 FXYD5-207ENST00000541435 898 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MIR4253-201ENST00000581187 68 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC138761.2-201ENST00000583878 343 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 CEACAM8-202ENST00000599005 544 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC006238.1-201ENST00000609787 534 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 uc_338.27-201ENST00000611385 169 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 FTX_5.1-201ENST00000618701 218 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.30-201ENST00000621054 280 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 PSG8-201ENST00000306511 1441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 TRIM60P14-201ENST00000513444 1419 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LARP7-201ENST00000324052 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 PAGE5-202ENST00000374952 428 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SNORA48-201ENST00000386847 135 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SYNE1-AS1-201ENST00000412161 553 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL138881.1-201ENST00000443445 789 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 DNAJC9-AS1-203ENST00000457758 548 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 WWTR1-IT1-201ENST00000463167 451 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RN7SL687P-201ENST00000480496 285 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 EXOSC1-210ENST00000485122 564 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC117482.1-201ENST00000490933 911 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC091980.1-201ENST00000524262 288 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms