Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SS18Q15532 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms