Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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FOXD4Q12950 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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FOXD4Q12950 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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FOXD4Q12950 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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FOXD4Q12950 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
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FOXD4Q12950 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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FOXD4Q12950 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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