Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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COL24A1Q17RW2 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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COL24A1Q17RW2 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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COL24A1Q17RW2 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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COL24A1Q17RW2 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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COL24A1Q17RW2 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL24A1Q17RW2 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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