Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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SYCP1Q15431 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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SYCP1Q15431 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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