Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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