Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CYP4F3Q08477 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms