Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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PTPRDP23468 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
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