Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms