Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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C10orf55Q5SWW7 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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C10orf55Q5SWW7 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C10orf55Q5SWW7 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
C10orf55Q5SWW7 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
C10orf55Q5SWW7 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
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