Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 KRTAP9-11P-201ENST00000431013 525 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL359921.1-201ENST00000433131 494 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 Z83841.1-201ENST00000433173 968 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL031963.2-201ENST00000433761 398 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC005040.1-201ENST00000437783 482 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ADAM7-203ENST00000441335 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC073254.1-202ENST00000447488 640 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CEACAM22P-203ENST00000455455 545 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC016700.3-201ENST00000455541 448 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC234782.3-201ENST00000461229 433 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PAQR9-AS1-202ENST00000493825 576 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINCR-0001-201ENST00000517732 562 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC091939.1-201ENST00000522704 691 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC02439-201ENST00000538783 450 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC003002.1-201ENST00000543226 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC027763.2-201ENST00000573755 539 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC011444.4-201ENST00000586415 418 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC01837-204ENST00000593211 570 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC020728.1-201ENST00000605749 1216 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PRYP3-202ENST00000607210 444 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL133351.5-201ENST00000612789 106 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC005086.2-201ENST00000624939 228 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SPRR5-201ENST00000636302 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 OMA1-201ENST00000371226 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 NAALAD2-204ENST00000525171 1613 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC125232.1-201ENST00000452554 1408 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 COQ3-202ENST00000369240 646 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MIR498-201ENST00000385134 124 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CD160-203ENST00000401557 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL627402.1-201ENST00000405276 735 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.2 ms