Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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IFT88Q13099 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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IFT88Q13099 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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IFT88Q13099 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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IFT88Q13099 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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IFT88Q13099 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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IFT88Q13099 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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