Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.5 ms