Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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CASQ1P31415 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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CASQ1P31415 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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CASQ1P31415 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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CASQ1P31415 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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CASQ1P31415 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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CASQ1P31415 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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CASQ1P31415 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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CASQ1P31415 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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