Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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SH3BP4Q9P0V3 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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SH3BP4Q9P0V3 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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SH3BP4Q9P0V3 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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SH3BP4Q9P0V3 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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SH3BP4Q9P0V3 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
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