Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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