Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms